Масс-спектрометры используются для анализа органических и неорганических соединений. Органические вещества по большей части представляют собой многокомпонентные смеси индивидуальных компонентов. Если взять, к примеру, жареную курицу, то ее запах будет состоять из 400 индивидуальных органических соединений, то есть компонентов. Задача при помощи масс-спектрометра узнать, что это за компоненты и узнать, сколько каждого соединения содержится в смеси. Для этих целей хорошо подойдет сочетание масс-спектрометрии с хроматографии. Газовая хроматография лучше всего подойдет для сочетания с ионным источником масс-спектрометра.