Люминесцентный микровидеоанализатор может применяться для диагностики наследственных и инфекционных (туберкулез, сибирская язва и др.) заболеваний, выявления в окружающей среде вирусов и микроорганизмов, сравнительного анализа последовательностей нуклеотидов в ДНК из разных организмов, детекции токсинов, для иммунологических исследований и др.